Arrivés à Namur en 1610, les jésuites y reprirent un petit collège en l’agrandissant et construisirent ensuite, attachée au collège, une église dédiée à Saint Ignace le fondateur de la Compagnie de Jésus. Pierre Huyssens, le maître du baroque belge, en fut l'architecte. Il n'en vit pas l’achèvement cependant car l’édification de l’église commencée rondement en 1620 se ralentit faute de fonds et dura finalement 20 ans: de 1621 en 1641 (millésime de la charpente). Quatre ans de travaux supplémentaires furent nécessaires avant son inauguration et consécration par l’évêque de Namur, Englebert Dubois (1645).

L’église est de style baroque des Pays-Bas, inspiré de l’église du Gesù à Rome et surtout de Saint Ignace (maintenant église Saint Charles Borromée) à Anvers.
Si le plan de Saint-Loup n'a rien de spécialement baroque, l'élévation et la décoration appartiennent bien à ce style: puissantes colonnes baguées à chapiteaux ioniques portant les arcades, agrafes, consoles, riche mouluration des entablements saillants...
Les "marbres" noirs de Mazy ou des bords de Meuse et les "marbres" rouges de Rochefort ou de Rance, s'unissent à l'opulence de la décoration de la voûte pour créer un intérieur grandiose et fastueux. La voûte centrale en berceau à lunettes (une voûte d'ogives semble à un moment avoir été envisagée) a été sculptée sur place dans du tuffeau de Maastricht et certains témoins infimes de polychromie et de dorure semblent attester le projet de peindre les motifs sculptés et d'intégrer des peintures dans les plus grands espaces, ce qui aurait évidemment créé une atmosphère encore bien plus somptueuse. Cette voûte clairement subdivisée par les doubleaux et un compartimentage de cartouches s'orne de motifs luxuriants et naturalistes, de pommes, grenades, raisins, dattes, prunes, poires, pois, artichauts, navets, feuilles et fleurs. D'origine maniériste, ces ornements de style auriculaire dont on trouve la source la plus précise chez Francart, qui collabora avec Huyssens à Bruges, montrent un symbolisme vitaliste de fécondité en accord avec la Contre-Réforme.

La façade, refaite au XIXe siècle et inaugurée en 1867 reprend la façade originale si ce n'est pour le matériau, de la pierre bleue à la place du marbre noir qui s'était très rapidement détérioré. Cette façade est également typiquement baroque par le mouvement convexe au centre, les colonnes et pilastres annelés, à chapiteaux ioniques ou corinthiens, les larges entablements à ressauts séparant les trois étages, le portail à fronton courbe puissamment crofilé, les niches à statues etc. Les contreforts annelés et les murs-boutants à ailerons entre les fenêtres animent les façades latérales.

Tour : Les plans de Huyssens prévoyaient une tour-clocher au chevet de l’église (derrière l’abside) dont l'élancement aurait correspondu au verticalisme du frontispice. En 1645 sa hauteur ne dépassait pas la nef ; elle ne fut jamais achevée.

Saint-Loup est donc un superbe exemple de l'architecture du catholicisme triomphant qui, par l'éclat de ses couleurs et de ses formes, devait faire pénétrer le fidèle dans l'atmosphère du Paradis tant espéré.